技术原理
RIP-Seq利用目标蛋白特异性抗体富集RNA-蛋白复合物，随后分离RNA并进行测序，研究与目标蛋白相关的RNA种类和富集情况。实验与分析设计需考虑抗体适配性及输入和对照设置。
应用方向
- 筛选与目标蛋白相关的编码或非编码RNA
- 比较不同条件下的RNA富集变化
- 探索RNA结合蛋白的转录后调控作用
方法特点
- 在转录组范围筛选蛋白相关RNA
- 可覆盖mRNA、lncRNA等不同RNA类型
- 与CLIP-Seq互补，主要用于相关RNA富集筛选
服务流程
- 01
评估样本、目标RBP与抗体
- 02
免疫富集RNA-蛋白复合物
- 03
RNA纯化、建库与测序
- 04
相关RNA识别、富集比较与功能分析
流程为技术路线概览，实验与分析细节根据样本条件和研究目标确定。