技术原理
ATAC-Seq通过转座酶对可接近的染色质进行切割和接头插入,结合测序建立开放染色质图谱。适合比较细胞状态、实验处理或组织之间的可及性变化,并与RNA-Seq、ChIP-Seq等数据结合研究基因调控。
应用方向
- 比较处理组与对照组的开放染色质区域
- 筛选候选调控元件并开展motif分析
- 关联表达变化与染色质状态,形成调控假设
方法特点
- 实验流程相对精简,适合低起始量项目评估
- 从全基因组范围研究染色质可及性
- 可与转录组及蛋白-DNA互作数据联合分析
服务流程
- 01
细胞或细胞核制备与质量评估
- 02
Tn5转座反应并插入测序接头
- 03
文库扩增、质控与测序
- 04
开放区域识别、差异分析与调控注释
流程为技术路线概览,实验与分析细节根据样本条件和研究目标确定。